BLASTP是一种用于蛋白质序列比对的常用算法。简单来说，BLASTP利用一个已知的蛋白质序列数据库对一个待比对的蛋白质序列进行匹配。通过BLASTP比对，我们可以很快地找到与待比对蛋白质相近的已知蛋白质序列，从而预测待比对蛋白质的功能、结构等信息。
BLASTP的原理基于Smith-Waterman算法，当然现在的BLASTP算法在效率和准确性上都要高于Smith-Waterman算法。BLASTP的核心思想是建立一个库中所有蛋白质序列的kmer索引，然后将待比对蛋白质序列拆分为多个kmer，与库中的kmer进行比对，最后通过组合符合比对条件的kmer来预测匹配的蛋白质序列。
除了BLASTP，还有BLASTX、TBLASTN等多个版本，不同版本主要针对DNA或RNA序列的比对。BLASTP广泛应用于生物信息学研究中的基因功能注释、蛋白质家族分析、蛋白质结构预测等方面。
通过BLASTP比对，我们可以大大缩短蛋白质序列分析的时间，预测待比对蛋白质的功能、结构等信息。欢迎大家尝试使用。
